Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA48.6-201ENST00000391156 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB1C-201ENST00000409159 606 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL18AP7-201ENST00000435924 524 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244098.1-201ENST00000436499 275 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357127.1-201ENST00000451295 438 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004947.1-202ENST00000457000 576 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016968.1-201ENST00000479610 697 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX8-211ENST00000497038 816 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093484.3-201ENST00000578296 449 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL620P-201ENST00000610816 303 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158077.1-201ENST00000616744 174 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.197-201ENST00000618956 303 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016292.2-201ENST00000618967 210 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092135.2-201ENST00000624702 506 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT2-201ENST00000367267 7614 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A5-205ENST00000454036 3593 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF266-202ENST00000588221 3503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DEPDC5-205ENST00000400248 5307 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNA2-211ENST00000639233 5256 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LYPD4-203ENST00000609812 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF709-201ENST00000397732 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SPOCD1-214ENST00000533231 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN19-203ENST00000539749 3517 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-203ENST00000461854 3462 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PALB2-201ENST00000261584 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO2A-202ENST00000375077 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K1-202ENST00000348806 5433 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-203ENST00000413689 8504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC12-201ENST00000311303 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms