Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms