Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRIM32Q13049 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRIM32Q13049 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms