Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms