Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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DDB1Q16531 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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DDB1Q16531 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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