Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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CAPSQ13938 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CAPSQ13938 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CAPSQ13938 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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