Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ATP1A4Q13733 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms