Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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