Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NUP160Q12769 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NUP160Q12769 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms