Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRAP18433 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRAP18433 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRAP18433 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRAP18433 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRAP18433 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRAP18433 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRAP18433 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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