Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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FOXQ1Q9C009 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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