Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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