Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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C9orf135Q5VTT2 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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