Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CSPP1Q1MSJ5 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CSPP1Q1MSJ5 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CSPP1Q1MSJ5 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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