Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
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