Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCINQ13939 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCINQ13939 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms