Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
HTR4Q13639 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
HTR4Q13639 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
HTR4Q13639 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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HTR4Q13639 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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HTR4Q13639 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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HTR4Q13639 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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HTR4Q13639 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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HTR4Q13639 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HTR4Q13639 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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