Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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AP3B2Q13367 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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AP3B2Q13367 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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AP3B2Q13367 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3B2Q13367 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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AP3B2Q13367 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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AP3B2Q13367 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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AP3B2Q13367 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
AP3B2Q13367 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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