Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN12Q05209 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms