Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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