Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR47-205ENST00000400794 4134 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELK3-201ENST00000228741 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOS2-201ENST00000313735 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTRK3-221ENST00000629765 2714 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P16-201ENST00000452798 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP004245.1-201ENST00000530434 259 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007751.2-201ENST00000534173 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6127-201ENST00000614019 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020658.3-201ENST00000568093 4028 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYRFL-205ENST00000552032 3139 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-4Q9BYQ2 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms