Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PTPRNQ16849 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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