Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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RTN1Q16799 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTN1Q16799 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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