Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms