Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CNGB1Q14028 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms