Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms