Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXC1Q12948 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXC1Q12948 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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