Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SPG7Q9UQ90 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms