Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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KNOP1Q1ED39 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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