Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRNQ16849 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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