Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZNF239Q16600 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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