Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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