Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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