Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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