Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMG9Q9H0W8 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms