Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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