Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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SNX29Q8TEQ0 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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SNX29Q8TEQ0 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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SNX29Q8TEQ0 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SNX29Q8TEQ0 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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SNX29Q8TEQ0 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SNX29Q8TEQ0 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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