Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MKRN3Q13064 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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