Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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KCNQ1P51787 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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KCNQ1P51787 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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KCNQ1P51787 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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KCNQ1P51787 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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KCNQ1P51787 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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KCNQ1P51787 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
KCNQ1P51787 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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