Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTATSF1O43719 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTATSF1O43719 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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