Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms