Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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