Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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