Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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MKRN4PQ13434 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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MKRN4PQ13434 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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MKRN4PQ13434 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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MKRN4PQ13434 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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MKRN4PQ13434 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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