Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms