Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKP2Q13309 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms