Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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