Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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