Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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