Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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